MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 7273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	TTTA	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009513	T	7	7	11	17	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009513	ATT	2	6	19	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009513	AAT	2	6	39	44	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009513	CT	3	6	166	171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009513	CTG	2	6	178	183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009513	AT	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009513	ATT	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009513	AC	3	6	271	276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009513	T	6	6	291	296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009513	ATT	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009513	AGG	2	6	367	372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009513	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009513	TAA	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009513	CTA	3	9	1812	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009513	AT	3	6	1843	1848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009513	TA	3	6	1850	1855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009513	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009513	TGTTT	2	10	3061	3070	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009513	TAA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009513	A	6	6	3169	3174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009513	TAA	2	6	3206	3211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009513	AAT	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009513	TGT	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009513	A	6	6	6593	6598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009513	GGA	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009513	TA	4	8	9147	9154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009513	TTC	2	6	9267	9272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009513	AGG	2	6	9302	9307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009513	AGTAA	2	10	9625	9634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009513	AG	3	6	9635	9640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009513	AGG	2	6	10235	10240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009513	A	6	6	10499	10504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009513	TAA	2	6	10505	10510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009513	TAT	2	6	10537	10542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009513	TAA	2	6	10603	10608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009513	GAT	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009513	TGATA	2	10	10647	10656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009513	TAA	2	6	10669	10674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009513	AGG	2	6	10690	10695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009513	A	7	7	14683	14689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009513	GAG	2	6	14710	14715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009513	T	6	6	16282	16287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009513	TTA	2	6	16298	16303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009513	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009513	ATG	2	6	16326	16331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009513	TAG	2	6	17877	17882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009513	TA	3	6	17915	17920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009513	A	6	6	17944	17949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009513	ATT	2	6	17953	17958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009513	ATT	2	6	17965	17970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009513	A	6	6	17976	17981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009513	TA	3	6	17997	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009513	ATGA	2	8	18021	18028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009513	GCA	2	6	18033	18038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009513	GAA	2	6	18099	18104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009513	ACA	2	6	18149	18154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009513	A	7	7	18175	18181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009513	ACC	2	6	18183	18188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009513	T	6	6	18204	18209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009513	ATG	2	6	18212	18217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009513	ACA	2	6	18298	18303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009513	ATA	3	9	18307	18315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009513	ATTT	2	8	18351	18358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009513	TAAAAT	2	12	18413	18424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009513	TCA	3	9	18913	18921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009513	AGG	2	6	18946	18951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009513	A	6	6	20733	20738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009513	AT	3	6	20969	20974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009513	TAAT	2	8	20988	20995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009513	GAG	2	6	25742	25747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009513	TTG	2	6	28043	28048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009513	TTAA	2	8	28116	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009513	TGG	2	6	28157	28162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009513	A	7	7	28668	28674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009513	GTA	2	6	28800	28805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009513	AAT	2	6	29979	29984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009513	GAA	2	6	29995	30000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009513	TGT	2	6	30025	30030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009513	TGT	2	6	30048	30053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009513	ATA	2	6	30076	30081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009513	TAAC	2	8	30113	30120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009513	AAC	2	6	30238	30243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009513	CAA	2	6	30334	30339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009513	A	6	6	30338	30343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009513	A	7	7	30367	30373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009513	ATT	3	9	30932	30940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009513	GTT	2	6	30945	30950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009513	GATTT	2	10	30999	31008	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009513	A	6	6	31300	31305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009513	AGG	2	6	31329	31334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009513	ATT	2	6	31899	31904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009513	ATT	3	9	31982	31990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009513	A	6	6	32012	32017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009513	GAG	2	6	32082	32087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009513	TAAA	2	8	33275	33282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009513	GCCA	2	8	33336	33343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009513	T	7	7	33394	33400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009513	T	7	7	33429	33435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009513	TAA	2	6	33472	33477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009513	ATT	2	6	33480	33485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009513	AG	3	6	33489	33494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009513	GA	3	6	34409	34414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009513	T	7	7	34454	34460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009513	TAT	2	6	34468	34473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009513	CAT	2	6	36088	36093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009513	ACCTA	2	10	36107	36116	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009513	CTT	2	6	36155	36160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009513	A	7	7	36163	36169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009513	AAATT	2	10	36194	36203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009513	TAA	2	6	36225	36230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009513	GTTA	2	8	36235	36242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009513	ATA	2	6	36248	36253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009513	A	6	6	36272	36277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009513	TTTA	2	8	36362	36369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009513	AAC	2	6	37767	37772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009513	TAT	2	6	37811	37816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009513	ATT	2	6	37827	37832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009513	TA	3	6	37874	37879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009513	GGA	2	6	37918	37923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009513	T	6	6	40949	40954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009513	T	7	7	40963	40969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009513	TAA	2	6	41032	41037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009513	ATT	2	6	41125	41130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009513	TA	4	8	41144	41151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009513	TTA	2	6	41152	41157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009513	TCA	2	6	41167	41172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009513	AAG	2	6	41173	41178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009513	T	6	6	41777	41782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009513	TA	3	6	41833	41838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009513	ATGA	2	8	41839	41846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009513	TAT	2	6	43330	43335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009513	AAT	2	6	43357	43362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009513	GTT	2	6	43370	43375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009513	ATT	3	9	43391	43399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009513	GGAT	2	8	43418	43425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009513	AGA	2	6	43456	43461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009513	ATT	2	6	43473	43478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009513	GATT	2	8	43495	43502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009513	TTAA	2	8	43587	43594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009513	ACG	2	6	44112	44117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009513	GAA	2	6	44138	44143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009513	T	6	6	44144	44149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009513	CTC	2	6	44150	44155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_009513	CCT	2	6	44606	44611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009513	TCC	2	6	46857	46862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009513	TA	3	6	46863	46868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009513	AAG	2	6	46890	46895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009513	CTT	2	6	46926	46931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009513	CTG	2	6	47008	47013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009513	AGA	2	6	47041	47046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009513	ATC	2	6	47079	47084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009513	TCC	2	6	47091	47096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_009513	ATT	2	6	47110	47115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_009513	ATTA	2	8	47167	47174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009513	ATT	2	6	47179	47184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_009513	ATTTA	2	10	47255	47264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009513	T	8	8	47275	47282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_009513	T	6	6	47296	47301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_009513	ATA	2	6	47326	47331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_009513	AGA	2	6	47557	47562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_009513	GAG	2	6	47681	47686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_009513	ATA	2	6	50005	50010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009513	TTA	2	6	50329	50334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_009513	T	6	6	50486	50491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_009513	ACT	2	6	120420	120425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_009513	TGA	2	6	120551	120556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_009513	AACATT	2	12	120663	120674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
444	NC_009513	ACT	2	6	120696	120701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_009513	ACT	3	9	120951	120959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_009513	TAG	2	6	121092	121097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_009513	ACA	2	6	121287	121292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_009513	TGT	2	6	121316	121321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_009513	TGG	2	6	121330	121335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
458	NC_009513	TGG	2	6	121354	121359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
459	NC_009513	ATC	2	6	121364	121369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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